diff --git a/doc/prd/workbench.md b/doc/prd/workbench.md
index ebdf9384..e9474937 100644
--- a/doc/prd/workbench.md
+++ b/doc/prd/workbench.md
@@ -321,7 +321,7 @@
   - `WB-COMPOSER-003-AC1` 智能模式发送后，主区先可见用户消息与 assistant 占位消息。
   - `WB-COMPOSER-003-AC2` AI 运行成功启动后，assistant 过程流通过事件逐步追加更新，而不是一次性静态替换。
   - `WB-COMPOSER-003-AC3` assistant 在 Brain 思考阶段于过程流最下方展示“让俺想想”并带有微光流动视觉反馈。运行未结束且尚无最终回答时预留同高占位，避免文案显隐导致消息区上挤抖动。当思考请求发起时展示文案；当收到输出、思考结束、出现“正在重试”过程组、已有可见流式 Thought / 最终回答、或 run 已结束（完成 / 失败 / 取消）时，必须隐藏“让俺想想”。
-  - `WB-COMPOSER-003-AC4` assistant turn 中 brain 最终输出始终位于过程流下方，并按 markdown 渲染；最终回答在内容分片到达后直接流式渲染，不展示独立收尾等待层；金额等普通文本中的单个 `$` 不作为公式边界，数学公式使用 `$$...$$` 语法；无序和有序列表分别显示圆点和序号；内部文件链接打开右侧文件预览，网页链接打开右侧内置浏览器；若当前伙伴已有浏览器 Tab 正停留在同一 URL，则激活该 Tab，不新开。
+  - `WB-COMPOSER-003-AC4` assistant turn 中 brain 最终输出始终位于过程流下方，并按 markdown 渲染；最终回答在内容分片到达后直接流式渲染，不展示独立收尾等待层；金额等普通文本中的单个 `$` 不作为公式边界，数学公式使用 `$$...$$` 语法；无序和有序列表分别显示圆点和序号；链接图标和链接文字与周围正文沿基线对齐；内部文件链接打开右侧文件预览，网页链接打开右侧内置浏览器；若当前伙伴已有浏览器 Tab 正停留在同一 URL，则激活该 Tab，不新开。
   - `WB-COMPOSER-003-AC5` 决策层（Thought）只展示面向用户的短摘要，不得展示模型原始长篇推理；决策层出现时，当前“让俺想想”必须立即隐藏；已落地的 Thought 使用浅灰色（#787774）文本呈现思考状态；未超出单行时不展示折叠图标，超出单行时默认以单行省略号截断展示且不常驻图标，鼠标悬浮时显示展开图标，点击展开后常驻浅灰卡片背景并展示收起图标，展开内容受最大高度限制（超出纵向滚动），流式阶段平铺展开。
   - `WB-COMPOSER-003-AC6` 过程流使用用户可理解的文案，不直接暴露内部 tool 名或底层事件名；两次 Thought 之间的工具调用（含 `learn_skill`）合并为一个 Activity 面板，展开后按时间平铺自然语言说明；压缩与重试单独成行。Activity header 汇总规则见 `WB-COMPOSER-009-AC5`；等待审批时的 header 与审后工具行图标见 `WB-BLOCKER-001-AC6` / `WB-BLOCKER-001-AC7`。
   - `WB-COMPOSER-003-AC7` AI 输出中切到 Settings 或触发界面重新挂载后，回到 Workbench 能通过伙伴消息记录投影恢复过程流、partial answer、最终回答或等待审批状态。
@@ -479,7 +479,7 @@
 
 #### WB-SCOPE-002 `@` 插入与删除规则
 
-- 系统行为：候选可通过键盘或鼠标插入为内联 token；目录、文件和网页资料都可作为合法 token 插入；输入区支持多个已插入 token 共存；token 使用无边框的紧凑图标加名称样式展示。目录、网页、PDF、DOCX、PPT/PPTX、Excel 使用各自的专属样式；Markdown、TXT 和其他文件统一使用普通文件样式。文字与图标保持同色。按 `Backspace` 可移除参考资料；发送后，用户消息中保留本轮参考资料 token 回显，样式与输入区 token 保持一致。
+- 系统行为：候选可通过键盘或鼠标插入为内联 token；目录、文件和网页资料都可作为合法 token 插入；输入区支持多个已插入 token 共存；token 使用无边框的紧凑图标加名称样式展示。目录、网页、PDF、DOCX、PPT/PPTX、Excel 使用各自的专属样式；Markdown、TXT 和其他文件统一使用普通文件样式。文字与图标保持同色，token 名称基线与相邻正文对齐。按 `Backspace` 可移除参考资料；发送后，用户消息中保留本轮参考资料 token 回显，样式与输入区 token 保持一致。
 - 验收：
   - `WB-SCOPE-002-AC1` 目录、文件或网页资料插入成功后，参考资料以 token 形式保留在输入流中，并进入后续发送参数。
   - `WB-SCOPE-002-AC2` 输入区支持多个已插入 token 共存，而不是后插入覆盖前一个范围。
diff --git a/src/renderer/src/assets/base.css b/src/renderer/src/assets/base.css
index 04afc65b..07450f39 100644
--- a/src/renderer/src/assets/base.css
+++ b/src/renderer/src/assets/base.css
@@ -1739,12 +1739,7 @@ mark {
 }
 
 .markdown-body .markdown-reference-link {
-  display: inline-flex;
-  align-items: baseline;
-  gap: 0.35rem;
-  max-width: 100%;
-  min-width: 0;
-  vertical-align: middle;
+  vertical-align: baseline;
   color: var(--notion-accent-blue);
   text-decoration: none;
   text-underline-offset: 3px;
@@ -1753,18 +1748,28 @@ mark {
 
 .markdown-body .markdown-reference-icon {
   display: inline-flex;
-  align-items: baseline;
+  align-items: center;
   justify-content: center;
   flex-shrink: 0;
+  width: 0.95em;
+  height: 0.95em;
+  margin-right: 0.35rem;
   color: var(--notion-accent-blue);
   line-height: 1;
+  vertical-align: -0.12em;
+}
+
+.markdown-body .markdown-reference-icon svg {
+  display: block;
+  width: 0.9em;
+  height: 0.9em;
 }
 
 .markdown-body .markdown-normal-link {
   color: var(--notion-accent-blue);
   text-decoration: none;
   text-underline-offset: 3px;
-  vertical-align: middle;
+  vertical-align: baseline;
   word-break: break-word;
   overflow-wrap: anywhere;
 }
diff --git a/src/renderer/src/components/workbench/WorkbenchComposer.tsx b/src/renderer/src/components/workbench/WorkbenchComposer.tsx
index 4111dd4f..5f2b4d5e 100644
--- a/src/renderer/src/components/workbench/WorkbenchComposer.tsx
+++ b/src/renderer/src/components/workbench/WorkbenchComposer.tsx
@@ -990,7 +990,7 @@ const WorkbenchComposer: React.FC<WorkbenchComposerProps> = ({
             aria-multiline="true"
             tabIndex={0}
             spellCheck={false}
-            className="block min-h-[32px] w-full whitespace-pre-wrap break-words bg-transparent text-[15px] leading-6 text-[#37352F] outline-none [&_[data-role='scope-token']]:align-middle"
+            className="block min-h-[32px] w-full whitespace-pre-wrap break-words bg-transparent text-[15px] leading-6 text-[#37352F] outline-none [&_[data-role='scope-token']]:align-baseline"
             data-testid={workbenchSelectors.input}
             onInput={handleEditorInput}
             onKeyDown={handleEditorKeyDown}
diff --git a/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceIcon.tsx b/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceIcon.tsx
index 3f091417..845ab2d5 100644
--- a/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceIcon.tsx
+++ b/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceIcon.tsx
@@ -10,13 +10,13 @@ type ReferenceIconProps = {
 const iconSizeClassName = {
   sm: 'h-[18px] w-[18px]',
   md: 'h-[21px] w-[21px]',
-  inline: 'h-[1.22em] w-[1.22em]'
+  inline: 'h-[0.9em] w-[0.9em]'
 } as const
 
 const containerSizeClassName = {
   sm: 'h-[22px] w-[22px]',
   md: 'h-8 w-8',
-  inline: 'h-[1.34em] w-[1.34em]'
+  inline: 'relative top-[0.1em] h-[1em] w-[1em]'
 } as const
 
 const DocumentGlyph: React.FC<{
diff --git a/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceInlineToken.tsx b/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceInlineToken.tsx
index a5411ed8..ac92647f 100644
--- a/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceInlineToken.tsx
+++ b/src/renderer/src/components/workbench/composer/ReferenceInlineToken.tsx
@@ -18,7 +18,7 @@ export const ReferenceInlineToken: React.FC<ReferenceInlineTokenProps> = ({
 
   return (
     <span
-      className={`inline-flex max-w-full items-center gap-[2px] align-[-0.08em] text-[0.9em] font-medium leading-[inherit] ${visualSpec.labelClassName} ${className}`}
+      className={`inline-flex max-w-full items-baseline gap-[2px] align-baseline text-[0.9em] font-medium leading-[inherit] ${visualSpec.labelClassName} ${className}`}
       data-role={role}
     >
       <ReferenceIcon reference={reference} size="inline" />
diff --git a/src/renderer/src/components/workbench/composer/utils.ts b/src/renderer/src/components/workbench/composer/utils.ts
index ac7c9ba4..66ff8431 100644
--- a/src/renderer/src/components/workbench/composer/utils.ts
+++ b/src/renderer/src/components/workbench/composer/utils.ts
@@ -133,7 +133,7 @@ export const readComposerNodesFromEditor = (
 const appendReferenceIcon = (container: HTMLElement, scope: SelectedReference): void => {
   const visualSpec = getReferenceVisualSpec(scope)
   const icon = document.createElement('span')
-  icon.className = `inline-flex h-[1.34em] w-[1.34em] shrink-0 items-center justify-center ${visualSpec.iconClassName}`
+  icon.className = `relative top-[0.1em] inline-flex h-[1em] w-[1em] shrink-0 items-center justify-center ${visualSpec.iconClassName}`
   icon.dataset.referenceIconKind = visualSpec.kind
 
   const svg = document.createElementNS('http://www.w3.org/2000/svg', 'svg')
@@ -142,7 +142,7 @@ const appendReferenceIcon = (container: HTMLElement, scope: SelectedReference):
     visualSpec.kind === 'directory' || visualSpec.kind === 'web' ? '0 0 24 24' : '0 0 18 18'
   )
   svg.setAttribute('aria-hidden', 'true')
-  svg.setAttribute('class', `h-[1.22em] w-[1.22em] ${visualSpec.iconClassName}`)
+  svg.setAttribute('class', `h-[0.9em] w-[0.9em] ${visualSpec.iconClassName}`)
 
   if (visualSpec.kind === 'directory' || visualSpec.kind === 'web') {
     svg.setAttribute('fill', 'none')
@@ -215,7 +215,7 @@ const appendReferenceIcon = (container: HTMLElement, scope: SelectedReference):
 export const createScopeTokenElement = (scope: SelectedReference): HTMLElement => {
   const visualSpec = getReferenceVisualSpec(scope)
   const token = document.createElement('span')
-  token.className = `inline-flex max-w-full items-center gap-[2px] align-[-0.08em] text-[0.9em] font-medium leading-[inherit] ${visualSpec.labelClassName}`
+  token.className = `inline-flex max-w-full items-baseline gap-[2px] align-baseline text-[0.9em] font-medium leading-[inherit] ${visualSpec.labelClassName}`
   token.contentEditable = 'false'
   token.dataset.role = 'scope-token'
   token.dataset.scopeKey = getScopeKey(scope)